遗憾的是，笑容明媚的小泽在进入古稀之年后，一直在和病魔缠斗。从2006年起，小泽征尔先是患上肺炎和带状疱疹，又在2009年底，被查出患食道癌。自此，他的健康状况起伏不定，常缠绵病榻。即便如此，小泽征尔也没有放弃对舞台的热爱。

2010年8月，时隔半年再出现在人们视野中的小泽征尔，消瘦了许多。他叹息道：“没想到一次手术竟让体重减轻了15公斤……脚疼得走6步就要坐下歇一歇。”但当天，他还进行了复出公开排练。

他说：“经过与病魔斗争，对人生和艺术的内涵有了更加深刻的认识。今天是休养后第一次在公众面前指挥，我觉得自己迎来了人生第二个春天”。

“对小泽先生而言，音乐就是人生不可缺少的燃料……只有用自己的双手编织音乐，赋予其鲜活的生命，再呈现于众人眼前(甚至该说，唯有通过这个过程)，他才能感觉到自己真正活着。”作家村上春树曾在《与小泽征尔共度的午后音乐时光》中写道。